Filialas, siekdamas jam nustatytų veiklos tikslų, atlieka šias funkcijas:
1. išsaugodamas ir populiarindamas Filialui priskirtą NDF dalį:
1.1. tvarko saugomų dokumentų apskaitą;
1.2. rengia informacijos paieškos priemones (apyrašus, rodykles ir kt.);
1.3. atlieka saugomų dokumentų fizinės būklės stebėseną;
1.4. papildo NDF nevalstybinių organizacijų, privačių juridinių ar fizinių asmenų veiklos dokumentais, iš užsienio valstybių gautais Lietuvos istorinio paveldo ar su Lietuva susijusiais dokumentais, įskaitant dokumentų ar jų kopijų įsigijimą;
1.5. tvarko į Filialą perduotus nesutvarkytus dokumentus;
1.6. kaupia informaciją apie Lietuvai reikšmingą dokumentinį paveldą, esantį užsienio valstybėse;
1.7. bendradarbiaudamas su mokslo ir studijų institucijomis atlieka saugomų dokumentų tyrimus;
1.8. rengia, leidžia ir platina neperiodinius leidinius;
1.9. teikia informaciją valstybės ir savivaldybių institucijoms, įstaigoms ir įmonėms, kitiems juridiniams ir fiziniams asmenims, nagrinėja asmenų prašymus ir skundus;
1.10. teikia fiziniams ir juridiniams asmenims susipažinti saugomus dokumentus ar jų kopijas tam skirtose Filialo patalpose, asmenų prašymu pagamina dokumentų kopijas ar nuorašus;
1.11. teikia metodinę pagalba valstybės ir savivaldybių institucijoms, įstaigoms ir įmonėms, perduodančioms dokumentus į Filialą;
1.12. derina valstybės ir savivaldybių institucijų, įstaigų, įmonių, perduodančių dokumentus į Archyvą, pateiktus apskaitos dokumentų duomenis Elektroninio archyvo informacinėje sistemoje ir Dokumentų valdymo bendrojoje informacinėje sistemoje;
1.13. teikia Archyvo direktoriui pasiūlymus dėl valstybės ir savivaldybių institucijų, įstaigų ir įmonių, perduodančių valstybės archyvams nuolat saugomus dokumentus, sąrašo pakeitimo;
1.14. atlieka valstybės ir savivaldybių institucijų, įstaigų, įmonių, perduodančių dokumentus į Filialą, veiklos dokumentų vertės ekspertizę ir nustato dokumentų saugojimo terminus;
1.15. teikia pasiūlymus dėl dokumentų ir archyvų valdymo ir naudojimo srities poįstatyminių teisės aktų projektų;
2. užtikrindamas prieigą prie valstybės dokumentinio paveldo, formuodamas ir stiprindamas visuomenės kultūrinį ir pilietinį tapatumą, ugdydamas istorinę savimonę:
2.1. atlieka LR dokumentų ir archyvų įstatymo 5 straipsnio 4 dalies 1-9 punktuose nustatytas funkcijas;
2.2. organizuoja neformalųjį vaikų ir suaugusiųjų švietimą, rengia ir vykdo edukacijos programas;
2.3. rengia parodas Lietuvoje ir užsienyje, organizuoja seminarus, konferencijas ir kitus renginius;
2.4. skaitmenina saugomus dokumentus, juos viešina Elektroninio archyvo informacinėje sistemoje ir Filialo valdomose ar naudojamose skaitmeninėse kolekcijose, rengia ir vykdo skaitmeninimo projektus, bendradarbiauja skaitmeninino projektuose Lietuvoje ir užsienyje;
2.5. rengia aprašomąją informaciją apie Filialo saugomus dokumentus ir viešina Elektroninio archyvo informacinės sistemos priemonėmis;
2.6. atlieka kitas Archyvo direktoriaus pavestas funkcijas.