KRVA Alytaus filiale saugoma Nacionalinio dokumentų fondo dalis

Sovietų okupacijos laikotarpio (1944 –1990 m. kovo 10 d.) dokumentų kompleksas sudaro didesniąją saugomų dokumentų dalį. Tai Alytaus miesto ir rajono, Druskininkų miesto, Lazdijų miesto ir rajono, Varėnos miesto ir rajono valstybės ir vietos savivaldos institucijų bei įmonių, įstaigų, organizacijų veiklos dokumentai. Archyve sukaupta ir saugoma šio laikotarpio dabartinės Alytaus apskrities teritorijoje veikusių vietos savivaldos institucijų: miestų, rajonų, apylinkių Darbo žmonių deputatų tarybų (nuo 1977 m. - Liaudies deputatų tarybų) vykdomųjų komitetų dokumentai, teismų, notarinių kontorų, švietimo, kultūros, sveikatos apsaugos įstaigų, pramonės įmonių, žemės ūkio įmonių: mašinų - traktorių stočių, tarybinių ūkių, kolūkių dokumentai.
Nepriklausomybės laikotarpio (nuo 1990 m. kovo 11 d.) dokumentų kompleksas dar tik kuriamas. Šiuo metu jau sukauptus šio laikotarpio dokumentų fondus sudaro apylinkių tarybų ir viršaičių dokumentai, apylinkių agrarinių reformų tarnybų dokumentai (juose atsispindi nuosavybės teisių į turėtą žemę atkūrimo procesų pradžia, kolektyvinių ūkių veiklos kardinalių pasikeitimų, reformų pradžia), savivaldos institucijų – Alytaus ir Druskininkų miestų, Alytaus, Lazdijų ir Varėnos rajonų savivaldybių administracijų 1990-1998 m. dokumentai (juose atsispindi po Lietuvos Respublikos Nepriklausomybės atkūrimo sudėtingi vietos savivaldos institucijų priimti sprendimai, susiję su dideliais pertvarkymais ekonomikoje, ūkyje, ekonominės blokados laikmečiu), 1995-2010 m. funkcionavusios Alytaus apskrities viršininko administracijos nuolat saugomi veiklos dokumentai. KRVA Alytaus filiale taip pat saugomi Alytaus apskrities vyriausiojo policijos komisariato, Alytaus apskrities teritorijoje esančių apylinkių teismų, miškų urėdijų, Alytaus apskrities valstybinės mokesčių inspekcijos, Alytaus teritorinės darbo biržos, Alytaus teritorinės ligonių kasos, Alytaus regiono aplinkos apsaugos departamento, Alytaus kolegijos, Daugų technologijos ir verslo mokyklos ir kai kurių kitų mokyklų bei gimnazijų veiklos dokumentai.