Kauno regioninio valstybės archyvo Alytaus filialo pradžia siekia 1944-uosius metus, kai buvo  įkurtas Alytaus apskrities valstybinis archyvas. Jo pirmoji buveinė buvo Alytaus apskrities (vėliau rajono) DŽDT vykdomojo komiteto patalpose adresu: K. Požėlos g. 23, Alytus. Archyvas buvo pavaldus Lietuvos SSR vidaus reikalų liaudies komisariatui (nuo 1946 metų - Vidaus reikalų ministerija).

Vadovaujantis Lietuvos SSR vidaus reikalų liaudies komisaro 1944 m. rugsėjo 25 d. įsakymu Nr.19 „Dėl vidaus reikalų liaudies komisariato apskričių valstybinių archyvų veiklos atkūrimo“ ir po to sekusiu vietinės valdžios teisės aktu – Alytaus apskrities vykdomojo komiteto 1945 m. balandžio 29 d. nutarimu  Nr. 4/73 „Dėl sąjunginio SSSR archyvinio fondo dokumentinės medžiagos surinkimo ir perdavimo į apskrities valstybinį archyvą“ pradėta rinkti išlikusius dokumentus:  sudarytus Lietuvos Nepriklausomybės laikotarpiu bei sovietinės bei vokiečių okupacijų metu, spręstas klausimas dėl Archyvo patalpų, pradėtas priimtų dokumentų tvarkymas, rūpintasi dokumentų saugumo užtikrinimu ir kt.

Po 1950 m. įvykusios administracinės teritorinės reformos Archyvas pavadintas Alytaus rajono valstybiniu archyvu.

            Iki 1954 m. Archyvas priklausė Lietuvos SSR VRM archyvų skyriui, o nuo 1954 m. tapo pavaldus Alytaus rajono darbo žmonių deputatų vykdomajam komitetui, tačiau kaip ir kitiems Lietuvoje tuo metu veikusiems rajonų valstybiniams archyvams, organizacinis metodinis vadovavimas paliktas Vidaus reikalų ministerijai.

Vadovaujantis Lietuvos SSR Ministrų tarybos 1963 m. spalio 30 d. nutarimu Nr. 640, 1964 m. sausio 1 d. panaikintas Alytaus rajono valstybinis archyvas ir įkurtas Lietuvos SSR Centrinio valstybinio archyvo Alytaus filialas (toliau – CVA filialas), kuris buvo pavaldus Archyvų valdybai prie Lietuvos SSR Ministrų tarybos. Naujai sukurto filialo zonai priskirti Alytaus, Eišiškių, Lazdijų, Varėnos rajonai ir Druskininkų miestas. Centriniam valstybės archyvui buvo perduoti  Nepriklausomos Lietuvos bei vokiečių okupacijos laikotarpiu veikusių įstaigų, organizacijų dokumentai, o personalo dokumentai grąžinti įmonėms ir įstaigoms.

Atkūrus Lietuvos Nepriklausomybę Archyvo pavadinimas dar keletą kartų keitėsi:

1990-07-25 - 1993-05-28 - Alytaus valstybinis archyvas;

1993-05-28 – 1997-03-07 - Alytaus apygardos archyvas;

1997-03-07 – 2016-12-31 - Alytaus apskrities archyvas;

nuo 2017-01-01 - Kauno regioninio valstybės archyvo Alytaus filialas (Vadovaujantis Lietuvos Respublikos Vyriausybės 2016 m. lapkričio 23 d. nutarimu Nr. 1173 „Dėl valstybės archyvų reorganizavimo ir valstybės archyvų reorganizavimo sąlygų aprašų patvirtinimo“, Alytaus apskrities

archyvas buvo reorganizuotas jungimo būdu, prijungiant  prie Kauno apskrities archyvo ir tapo Kauno regioninio valstybės archyvo Alytaus filialu).

Laikui bėgant, saugomų dokumentų skaičius tolydžio didėjo. 1951 metais Archyve buvo saugoma 30 955 saugojimo vienetų dokumentų, suskirstytų į 21 fondą. Šiuo metu (2020 metų sausio 1 d. duomenimis) Kauno regioninio valstybės archyvo Alytaus filiale saugomi 184 693 saugojimo vienetai archyvinių dokumentų, suskirstyti į 676 fondus ir užimantys 2160 tiesinius metrus lentynų.

Atnaujinimo data: 2024-01-09